在关系国计民生的食品安全学科领域，中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所联合国际组织、世界知名科研机构和企业，共同开展项目研究。通过共同研究增进了解，加强合作，推广先进技术。部分国际科技合作项目如下：

国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项

　　减少抗菌药物用量的畜禽健康养殖与动物福利综合技术研究与示范（项目编号：2017YFE0114400，2018-2020）

科技部重点科技项目

　　牛羊产品溯源检测技术研究(No. 2006DFA32170，2007-2008)

科技部科技合作专项

　　中国新西兰乳品综合识别溯源技术合作研究”(No. 2015DFG31890，2015-2018)

欧盟 Horizon 2020（SFS-46-2017: Alternative production system to address anti-microbial drug usage, animal welfare and impact on health）

　　HealthyLivestock （2018-2021）

欧盟第七框架BrightAnimal项目

　　中小农场（户）精准畜牧养殖综合技术措施研究(No. 227138，2009-2011)

欧盟援助亚洲项目

　　中国食品供应链中可持续性生产消费模型和认证工具研究(No. DCI-ASIE/2012/307-186，2013-2016)

国际原子能机构CRP项目

　　畜产品中苯并咪唑及其前体和代谢物多残留筛选与确认方法研究(No.15672，2009-2014)

　　稳定同位素技术在中国有机肉、茶叶溯源以及蜂蜜真实性判定中的应用(No. 16567，2010-2015)

　　使用稳定同位素及化学污染物分析技术对中国牛奶溯源(No.18057，2013-2018)

　　评估食品真实性、安全和质量的野外分析方法(No. D52040，2017-2021)

　　食品中混合污染物及残留的整合辐射和互补技术(No. D52041，2017-2022)

国际原子能机构RCA项目

　　使用核分析技术构建食品安全控制体系和食品追踪技术能力(No. RAS5062, 2012-2015)

国际原子能机构TC项目

　　促进稳定同位素技术在中国优质农产品真伪识别及产地溯源中的应用(No. CPR5022，2016-2017)

联合国粮农组织南南合作项目

　　农药残留监测能力建设(2015)

联合国粮农组织项目

　　中国食品欺诈及其经济驱动分析(2017-2018)

中意合作食品安全对话项目

　　EAT SAFE项目(2016-)

与奥特奇公司的科企合作项目

　　饲料毒理学研究(2017-)